南航设有14家分公司（新疆、北方、北京、深圳、海南、黑龙江、吉林、大连、河南、湖北、湖南、广西、台湾、珠海直升机）和厦门航空、汕头航空、贵州航空、珠海航空、重庆航空等5家附属公司。
1.厦门航空
厦门航空有限公司（XIAMEN AIR，简称“厦航”），成立于1984年7月25日，厦门航空是由民航局与福建省合作创办的中国首家按现代企业制度运营的航空公司，现股东为中国南方航空股份有限公司（55%）、厦门建发集团有限公司（34%）和福建省投资开发集团有限责任公司（11%）。 厦门航空承运人代码为“MF”，企业标志为“蓝天白鹭”。
厦航是中国唯一使用全波音系列飞机的航空公司，截止2015年4月11日，拥有全波音系列的116架飞机，平均机龄5.6年，经营国内航线220余条，国际及地区航线近30条，每周执行航班3200多个，构建了以厦门、福州、杭州为核心，覆盖全国、辐射东南亚、连接港澳台地区的航线网络，是中国民航唯一连续保持28年盈利的航空公司。
截止2017年12月31日，厦航第33个航空运输安全年，全年完成运输总周转量50亿吨公里、旅客运输量3270万人次，货邮运输量26万吨，同比分别增长24.4%、17.9%和8.3%，累计安全飞行近450万小时，荣获飞行安全“四星奖”，并成为全球首家荣获“IOSA 杰出成就猜缓奖”的航空公司。
2.汕头航空
汕头航空有限公司于1993年07月20日在汕头市工商行政管理局登记成稿兆橡立。法定代表人肖立新，公司经营范围包括国内航空客货运输业务（公共航空运输企业经营许可证有效期至2018年3月17日）等。
3.贵州航空
贵州航空有限公司是一家以贵阳为基地的小型航空公司。前身为贵州省航空公司，成立于1991年9月。1998年6月28日，与中国南方航空股份有限公司联合，组建了中国南方航空(集团)贵州航空有限责任公司。
4.珠海航空
珠海航空有限公司（简称南航珠海公司）是由中国南方航空集团与珠海格力电器集团于1995年6月3日合资组建并由中国南方航空集团控股的航空运输企业，于同年6月18日正式运营，主要提供由广东珠海至中国大陆、港澳台地区的客运、货运及邮运服务。珠海航空也是珠海三灶机场唯一的基地航空公司。
5.重庆航空
重庆航空有限责任公司（Chongqing Airlines）于2007年6月16日在重庆成立，注册资本总额为12亿元人民币，由中国南方航空股份有限公司和重庆市开发投资公司按6：4比例出资组建，是重庆市与中国南方航空合作的地方航空公司。其主基地机场为重庆江北国际机场。
重航目前拥有18架空客飞机，开通了重庆往返全国各地的40余条航线其中既包括北京、上海、键旁广州、深圳、武汉、南京、杭州、长沙等国内主要公、商务航线，也有至西双版纳、九寨沟、丽江、三亚等国内著名景点的黄金旅游航线，其中重庆至大理、腾冲、香格里拉等地更属独飞航线。
拓展资料：
在2008年，中国南方航空的旅客运输量达5824万人次，货邮运输量83万吨，运输总周转量94亿吨公里，分别占中国民航总量的30.2%、20.5%、24.4%。以载客总量计，中国南方航空排名世界第五，同时也是全亚洲载客量及飞机数量最多的航空公司。载货量亦为中国之冠。
中国南方航空集团公司是一家总部设在中国广州的中央企业，与中国航空集团公司和中国东方航空集团公司合称中国三大航空集团。旗下的上市航空公司中国南方航空股份有限公司是以蓝色垂直尾翼镶红色木棉花为公司标志，主要提供国内、港澳台地区和国际航空客运、货运及邮运服务。
