有
一、存在植物部位、颜色不同：
叶绿素b：高等植物、绿藻、眼虫藻、管藻，叶绿素b 呈黄绿色。
二、化学分子式的不同
叶绿素a分子式：C₅₅H₇₂O₅N₄Mg
叶绿素 b分子式：C₅₅H₇₀O₆N₄Mg
三、紫外分光光度吸收波长的不同
叶绿素a红区丛袜最大吸收峰在663nm附近，在蓝紫区为429nm附近闹丛
叶绿素b红区最大吸收峰在645nm附近，在蓝紫区为453nm附近
参考资料来源：百度百科-叶绿素
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