亲子鉴定所用的原理为孟德尔遗传定律。即孩子身上的遗传物质一半来自于父亲，一半来自于母亲。这源于精子形成过程中由于减数分裂，包含了男性一半的遗传物质，而卵子则含有女性一半的遗传物质。最后精卵结合形成了一个新的个体。
目前通用的亲子鉴定标记为STR微卫星标记，如在特定基因座上，孩子的基因型是17-18，则17或18两个等位基因应该在父亲或母亲身上找到，否则即不符合孟德尔遗传定律。
另外，亲子鉴定是法医学鉴定项目之一。
如果需要做亲子鉴定建议到本地的正规司法鉴定机构进行，具体可咨询当地司法局或本省司法厅，查询正规机构名录。目前网上亲子鉴定众多，建议仔细甄别，谨慎选择。
ABO血型鉴定的原理是根据红细胞上有或无A抗原或/和B抗原，将血型分为A型、B型、AB型及O型四种。可利用红细胞凝集试验，通过正（血清试验）反（细胞试验）定型准确鉴定ABO血型。所谓正定型是用已知抗A和抗B分型血清来测定红细胞上有无相应的A抗原或/和B抗原，所谓反定型是用已知A细胞和B细胞来测定血清中有无相应的抗A或抗B。
亲代：A型+A型 ，子代可能：A型、O型 ，子代不可能：B型、AB型亲代：B型+A型，子代可能：A型、B型、AB型、O型，子代不可能：无亲代：B型+B型 ，子代可能：B型、O型，子代不可能：A型、AB型亲代：一方或双方是AB型，子代可能：A型、B型、AB型，子代不可能：O型亲代：A型+O型，子代可能：A型、O型 ，子代不可能：B型、AB型亲代：B型+O型，子代可能：B型、O型 ，子代不可能：A型、AB型亲代：O型+O型，子代可能：O型 ，子代不可能：A型、B型、AB型注释：血型鉴定不能作为是否具有亲缘关系的标准，只有DNA亲子鉴定，才是确定是否具有亲缘关系的黄金标准。
亲子鉴定的基本原理：人类基因组是一个结构十分稳定的体系，同时又是一个变异的体系。在长期的进化过程中，基因组dna的序列不断发生变异。
这些变异有些被保存下来，导致了不同种族、群体和个体间基因组的差异和多态性，除同卵双生子外，没有两个个体基因组是完全相同的。 亲子鉴定是根据人类遗传学的理论和实践，从子代和亲代的形态构造或生理机能方面的相似特点，分析遗传特征，对可疑的父与子或母与子之间的亲生关系进行判断，并作出肯定或否定的结论。
法医学的亲子鉴定方法，有血型鉴定，外貌特征的对比，皮肤纹理的检查，遗传疾病的检查，耳垢的区别，味盲的检查，以及受孕期、生产期，生殖能力的推断等
