母后皇太后是皇帝的嫡母(皇帝父亲的正妻，即皇后)，而圣母皇太后是皇帝的生母。
母后皇太后的级别肯定要比圣母皇太后高，毕竟母后皇太后是故去皇帝的正妻，贵为皇后乃堂堂一国之母，无论如何也不是曾经作为妃子的圣母皇太后能比的。在那个礼法森严的封建社会，就连寻常百姓人家都讲究嫡庶之分，正妻有与丈夫同等的地位，正妻主内丈夫主外，这乃是天经地义。试想看看连民间都是如此，更何况是皇族呢？虽清时期嫡庶之分已无唐宋那么的严苛，但基本的尊卑还是要讲的，正妻就是正妻，庶妻就是庶妻，地位绝非可相提并论。而且事实证明，清朝时期出现的三次母后皇太后和圣母皇太后两宫并尊的情况，母后皇太后的地位永远都是高于圣母皇太后的。
顺治时期，由于皇太极的皇后和顺治帝的生母都尚在，随即尊博尔济吉特.哲哲为母后皇太后，而博尔济吉特.布木布泰则为圣母皇太后，其中布木布泰就是我们大家所熟知的孝庄，也就是“大玉儿”。
历史上对于她们两个人的记载并不多，不过据有关的文献可以看出来哲哲和布木布泰的关系并不差，两个人可谓是和睦相处，再者哲哲又是孝庄的亲姑姑，所以孝庄一直都很尊敬她。哲哲死了之后，顺治帝更是为她举办了盛大的葬礼，在当时顺治帝、顺治帝的子女们、后宫的妃手烂子们和文武百官及家眷们都为哲哲披麻戴孝，并举行了最高规格的祭奠礼仪，从这点可以看出哲哲的地位非常之高。而在当时哲哲即是皇太极的皇后，又是孝庄的亲姑姑，可想而知母后皇太后的地位是高于圣母皇太后的。
康熙时期，玄烨登基即尊顺治帝的第二位皇后，也就是仁宪皇太后为母后皇太后，尊自己的生母慈和皇太后为圣母皇太后，但是这两宫并列的时间只有2年，康熙二年康熙的生母慈和皇太后就因病去世了。
康熙时期仁宪皇太后的地位明显要高与慈和皇太后，这点我们可以从尊奉两宫后她们的住处看的出来。康熙在尊奉仁宪皇太后为母后皇太后的时候，是将她安置在慈仁宫的，慈仁宫在当时可是孝庄太皇太后当皇太后之时的住所，且在明清时期慈仁宫也都是用作皇太后的居所，而在当时只有仁宪皇太后迁往慈仁宫居住，而康熙的生母慈和皇太后却是没有资格入住慈仁宫，反到是继续生活在她之前作为妃子的寝宫。那么可想而知此时的母后皇太后的地位是也是高于圣母皇太后的。
同治年间，载淳登基后尊咸丰帝的第二位皇后，即慈安太后为母后皇太后，尊自己的生母慈禧太后为圣母皇太后。慈禧和慈安我想这是大家最为熟悉的两宫太后，这其中的慈禧曾经可是晚清同治之后五十余年间真正的掌控者，在当时整个大清都听她的。所以也正是因为这种影响，很多人都认为慈禧太后的权利要大于慈安太后。那么真的是这样的吗？实则不然。
先不说慈安手握着咸丰帝临死前给她的代表母仪天下唯薯唯的“御赏”印章，拥有着等同于皇帝的权利，慈安随时可以下诏处置慈禧，再者慈禧能够垂帘听政也完全都是因为慈安的支持，若无她的支持，慈禧想垂帘听政等同于痴人说梦。当然在当时慈安并不热衷于权利，她更想的是在后宫安享晚年，所以朝廷上一些琐碎的事情全都有慈禧做主，但是这并不代表慈安没有权利，可以说在当时小事可以有慈禧说了算，但是大事如果没有慈安的同意是绝对不行的。比如在为同治帝选皇后的事情上，当时慈禧看中的是凤秀之女富察氏，所以慈禧一直都想让同治选她做皇后，但是富察氏却并未被慈安看重，慈安看重的是崇绮之女阿鲁特氏，最终的结果我想都知道，那就是阿鲁特氏做了皇后，也就是孝哲毅皇后。
当然慈安太后这样稳压慈禧太后的事情还有很多，再不如诛杀安德海一事。当年同治时期的大太监安德海可谓是深受慈禧的宠爱，而安德海也借助着慈禧的宠爱胡作非为，但由于他有慈禧做靠山，所以无人敢把他怎样。而就在1869年8月安德海借助着替同治帝置办龙衣的名头，在沿路各地疯狂敛财，也到了山东境内，因太过于招摇被当时的巡抚丁宝桢抓获，由于当时的大清有明文规定，宦官不得出宫违者杀无赦，所以丁宝桢并将此时上报给了两宫太后和同治帝，作为慈禧的宠臣，慈禧当然选择力保他，而慈安觉得这安德海的确该杀，随即一声令下“立命诛之”，就这样安德海就被杀了。从这件事我们可以看出来，慈禧太后的权利远远没有慈安太后的大，当两方出现分歧的时候做决定的永远都是慈指培安太后。
所以上我们可以从以上的事例看出来，在清朝母后皇太后的地位和级别远远要高于圣母皇太后。毕竟在当时候“嫡庶之分”的礼制束缚下，即使贵为一国太后，作为庶妻的圣母皇太后也是不敢逾越半步的。
