游戏开始还是最基本的选择主角，之后进入游戏。↓出门后来到左上角的房间，正好对手从屋中出来，两人撞个正着。来到他家中，他准备完后便出发了。↓在村口遇到他，他便会加入队伍，一起来到左上方的湖边，发现了博士和男主角。↓两人走后，在草丛中留下了箱子，正当两人上前想调查时，突然从草丛中窜出了野生的小精灵，正当关键时候，发现箱子中竟然装有三只精灵球，老一套的三选一了。↓打败野生PM后。男主角回来取忘记的箱子。回到村口，发现了博士一行。回到家中，从妈妈手中得到了跑鞋，之后就可以按B加速移动了。↓出村后往右来到第一个村庄，在那里男主角已经等候多时了。进入研究所，博士将刚才那只小精灵送给了我们，现在可以为心爱纳蔽的小精灵取个名字了。此外，还可以得到精灵图鉴。出门后，男主角会为我们介绍整个村中各建洞埋州筑的用途。向上走时男主角会拦住去路。↓回家后从妈妈手中得到冒险手册。而对手的妈妈此时却跑来找自己的孩子，并希望主角能帮助捎件东西给他。↓向上来到コトブシテイ，在左边的一幢教学大楼中遇到了劲敌。把他妈妈的东西给他后可以得到城镇地图。在精灵中心回复体力后，出门会有一个男子上前希望帮他集齐三块ひきかえけん。在城中找到三个看上去比较委琐的大叔叔，从他们身上可以得到ひきかえけん。收齐全后，可以从男子的手上换到腕表。腕表的用途很多，按一下右边的红色方块可以切换功能，随着冒险的进行，还可以得到不少新的功能。从右边出城后，劲敌前来挑战。按照惯例，他的手上有持有克制我们手上的主角宠，不过现在还没有属性招式，轻松战胜后可以向右方的黑铁山前进了。↓刚进黑铁山，洞口的大叔就会送上秘传机06号（碎岩石）。不过因为没有徽章，暂时还无法使用。穿过洞窟来到クロガネシティ ，一个少年会把主角带到GYM前。刚巧劲敌也在GYM门口，不过从劲敌的口中得知馆主在黑铁山矿洞。从城下方进入矿坑，在最深处可以找到馆主，此时可以考虑收服一只小拳石，如此一来未来的碎岩和怪力工作都可以由他来完成。回到GYM，终于可以进入了，道馆的路线比较简单，馆主使用的是液笑岩石系的PM。选火系的话，建议等进化后习得音速拳再进入。战胜后可以得到技巧训练机76号。↓回到コトブシテイ，在上方的出口处遇到了博士和男主角，此时银河团出现，与男主角联手击败银河团。电视台的人还会送上饰品盒，在之后的选美比赛时可是有大用的。另外在左边的过道内可以得到破钓杆，至于可以钓起来的东西嘛…↓从コトブシテイ向北来到下一城市，在右上的屋中可以得到可达鸭浇水壶。另外，这家店今后还可以进行各种饰品的交换。从右来到205道路。在岔路口，发现上方的道路被银河团占领了。不管他，先向右继续前进，来到风力发电站，打败看门的守卫后没想到他把门锁了起来。回到刚才的城市，从左上角进入森林，里面有两个银河团的人会上前挑战。解救出被他们袭击的老伯后，从老伯的手中得到发电场钥匙。回到刚才的发电站，在发电站内打败银河团的干部。解救出博士后，原先被银河团占领的205号岔路便可以进入了。一直向上前进，中途房间中的大妈会帮助回复HP。↓进入上方的森林后，一位大姐因为害怕森林中出现的PM，希望和主角组队前进，答应后，带着她穿过森林。来到ハクタイシティ。在上方遇到一个研究员，她会送上秘传机01号。在PC中可以得到なつきチェッカ。↓来到GYM，从树丛中捉出四个训练员后馆主便会出现。在PC边的屋中可以得到たんけんセット。之后从下方出城，在过道中从研究员的手中可以得到学习装置。沿自行车道一路南下，在出口处遇到男主角，从他手中得到挑战机和寻宝机。通过颠簸山来到右边的ヨスガシティ。在城中见到了男主角，跟随他来到选美会场外，见到了此处的馆主，馆主在介绍了选美会场后便云游去了。在右下方的出口处，有一个大伯会送上一颗蛋。转了一圈后刚想从下方离开城市，劲敌再次出现，打败后从右下出城。一路右行来到一座幽灵塔处。在顶楼可以得到秘传机04号怪力。↓回到ヨスガシティ，向下方前进，经过一片沼泽时如果陷入其中可以不段按十字键跳出来。此处为水系GYM，道馆内需要不段升降水位来通过障碍。↓向右出城，沿路北上，来到トバリシティ。在游戏店左下方的房屋内与大叔交谈可以得到硬币盒。来到左上方的GYM，在GYM门外男主角再次出现，说了一些关于游戏厅的事便离开了。进入GYM，这里是一个推隔断的迷宫，馆主为格斗系，他的身上有波导勇者中的主角鲁卡里奥。出GYM后，男主角又找上门来，说他的图鉴被银河团抢走了。↓来到PC上方，帮助男主角打败银河团的人。进入银河团躲入的仓库，在里面可以得到秘传机02号飞天。↓回到ノモセシティ，在狩猎区的门边发现了银河团的身影，一路追赶，不想中途劲敌乱入。TF劲敌后继续向右追赶，在リッシこのほとり处追上银河团，打败他后，当初那个女博士会将秘传药交给主角。↓回到210号道路处，对挡路的可达鸭使用（直接按A就行）。前往上方的路中会起雾，雾中非必中技命中率都半减。在雾中摸索着来到カンナギタウン。↓在PC回复后前往镇中的洞窟，打倒守门的银河团，在调查遗迹中的壁画时，遗迹外的老太会进来，并送上秘03。↓回到ヨスガシティ，发现馆主回来了，这里的房间为三选一，调查前方的揭示板会发现非常幼稚的数学计算题。打倒馆主后可以使用冲浪。↓从218号水路向左来到ミオシティ，在过道中研究员会升级图鉴。前往GYM的途中劲敌再现，TF他后来到GYM，这里的馆主为钢系，打倒后可以使用怪力。坐船可以来到一个岛上，和阿肯（波导手机代言人）组队，一起打败最深处的银河团成员后如果身上有空位可以得到一枚蛋。回到ミオシティ，前往左上的图书馆，发现了劲敌和男主角及博士，博士说了一些关于神兽的事，此时发生了地震，为了查明事件原因，博士分别为三人安排了任务。↓此时可以先去ハクタイシティ右边方的山洞，使用怪力推开出口附近的石头。沿山脊向北前近。在エイチこのほとり尽头便是冰雪之镇キッサキシティ。此处的GYM需要使用惯性撞破雪球，馆主使用的PM都为冰系。↓来到リッシこのほとり上方的森林中，发现湖水已经被银河团抽掉，进入湖中心的洞内打败银河团的干部。再前往主角村右边的湖，帮助男主角一起打倒银河团的成员。再前往雪原上方的湖エイチこのほとり，触发剧情。另外在雪原左上方的木屋附近一个房间外有精灵球中装有秘08攀岩。↓回到トバリシティ，在银河团总部外与银河团成员对话，他会扔下钥匙。用钥匙打开原来拿秘02处的门，进入银河团基地，在深处得到钥匙后，回到银河团总部大楼正门，从那里进入大楼。在最上层打败银河团BOSS后得到大师球。从后方通道进入研究室，打倒干部后，解放出三神。↓回到クロガネシティ，从右边进入颠簸山腹，使用秘08爬上斜坡。来到颠簸山谷，一路向上可以到达神殿。此时银河团BOSS和干部会再次挑战，和劲敌一起解决干部后劲敌会帮助回复HP，打倒BOSS后，便可以向上与封面神兽迪亚鲁卡或是帕鲁基亚作战了。↓从リッシこのほとり向右来到最后的城市ナギサシティ，去城市右下角的灯塔打到馆主，之后便可以挑战最后的会馆了。得到徽章后来到上方的沙滩，与密桔对话后可以得到秘07登瀑。↓一路向上来到冠军之路，穿过冠军之路后便是精灵联盟了。在联盟中劲敌会再次挑战，打倒他后便可以进入四天王的房间。四天王分别以虫系、地系、火系、超能系的PM为主，最后冠军的便是一路上帮助主角的希罗娜，战胜她后便是结局动画了。
