1、含义不同。
3%为小规模纳税人增值税税率；17%为一般锋滚纳税人增值税税率。
2、享受的税收的政策不一样。
小规模纳税人不能抵扣进项税，只有一般纳税人才能抵扣进项税额。
一般纳税人抵扣进项税的条件：
（1）必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税。
（2）取得小规模纳税人在国税代开的增值税专用发票，可以按3%抵扣进项税。
3、发票性质不同
3%的税率在增值税普通发票使用较多的；17%税率常见于增值税专用发票。税法规定必须取得增值税专用发票才能抵扣进项税，进项增值税发票经过认证可以抵扣税金，普通发票不能抵税。
扩展资料
年增值税应税销售额达到标准的可以成为一般纳税人，此外对于生产型纳税人如果会计核算健全的，这一标准可以放宽至30万元人民币，但对非生产型商贸企业无行旦论其会计核算健全是否健全均要达到标准才能认定为一般纳税人。
另外，由于自1999年起国家强制推广税控加油机，并禁止非税控加油机的生产和销售，所以国家税务总局2001年12月3日发布国税函[2001]882号《关于加油站一律按照增值税一般纳税人征税的通知》规定。
规定从2002年1月1日起将所有从事成品油销售的加油站都认定为一般纳税人，而无论其规模是否达到标准和会计核算是否健全。
已认定为一般纳税人的企业如无下列行为，即使某一年度的应税销售额达不到标准通常也不取消其一般纳税人资格:
1、虚开增值税专用发票或者有偷、骗、抗税行为；
2、连续3个月未申报或者连续6个月纳税申报异常银带余且无正当理由；
3、不按规定保管、使用增值税专用发票、税控装置，造成严重后果。
参考资料来源：百度百科-增值税税率
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