1、大儿子：术赤，孛儿帖所生。
铁木真与孛儿帖结婚时，三姓蔑儿乞惕部的首领脱黑脱阿，为报其弟赤列都的未婚妻诃额仑当年被铁木真的父亲也速该所抢之仇，突袭了铁木真的营帐。在混战中，铁木真逃进了不儿罕山，他的妻子和异母却当了晌迹脱黑脱阿的俘虏。
等救回时孛儿帖已有身孕，而“术赤”二字是“客人”的意思。因此，从他的出生开始就不断有人怀疑术赤的血统，尤其是二弟察合台和三弟窝阔台常因此与其冲突。
2、二儿子：察合台，孛儿帖所生。
察合台是察合台汗国的创建者。察合台在蒙古帝国的政治生活中居有崇高地位，在重大问题上起着一定的决策作用。他不仅统治了成吉思汗给予的兀鲁思和军队，而且在别失八里自己的王国中也享有至高的权力。
3、三儿子：窝阔台，孛儿帖所生，
窝阔台衡清是蒙古帝国大汗，史称“窝阔台汗”。元太祖成吉思汗的第三子。1225年受封于也儿的石河上游和巴尔喀什湖以东一带，建斡耳朵于也迷里城。1229年忽里台大会被拥戴登基，管理整个蒙古帝国。
4、四儿子：拖雷，孛儿帖所生。
成吉思汗生前分封诸子，拖雷留在父母身边，继承父亲在斡难和怯绿连的斡朵儿、牧地和军队。成吉思汗留下的军队共有约12.9万人，其中大部分都由拖雷继承。1227年成吉思汗去世后，三儿子孛儿只斤·窝阔台继位，拖雷监国。
1232年率军击败金军，在回军途中病逝。其长子孛儿只斤·蒙哥即位后追上尊号，谥“英武皇帝”，庙号“睿宗”。
5、五儿子：兀鲁赤，早夭折，无后嗣。
6、六儿子：阔列坚，忽兰所生。
孛儿只斤·阔列坚虽然是庶子却很受父亲宠爱。后来他随拔都征俄罗斯的时候因箭伤而死。
有史载的成吉思汗女儿：
昌国大长公主，名火臣别吉（豁真别乞；火阿真伯姬，伯姬：音译，本作别乞。），孛儿帖所生，嫁给昌忠武王孛秃。
延安公主，名扯扯亦坚，孛儿帖所生。
赵国大长公主，名阿剌海别吉，孛儿帖所生，嫁给赵武毅王孛要合，无子。成吉思汗1206-1211年西征期间以及逝世以后，她以监国公主的身份代理朝政。
郓国公主，名秃满伦，孛儿帖所生。
阿儿答鲁黑，又译作阿勒塔伦，按塔伦，又名阿勒塔鲁罕，孛儿帖所生幼女。嫁给斡勒忽讷兀惕部的泰出（又译作塔出）驸马。有子术真伯（又称扎兀儿薛禅），术真伯先后娶元宪宗蒙哥之女咐谨前失邻公主和必赤合公主。
高昌公主，名也立可敦，嫁给亦都护巴而术·阿而忒·的斤。
参考资料：百度百科-成吉思汗
参考资料：百度百科-术赤
参考资料：百度百科-察合台
参考资料：百度百科-窝阔台
参考资料：百度百科-拖雷
参考资料：百度百科-阔列坚
