济宁医学院附属医院病理科始建于1978年，全面开展各个系统的病理学检查，面向全市及整个鲁西南开展了近200项免疫组织化学检查，为临床诊断、疾病治疗和判断病人预后提供科学依据。
主要业务工作有：常规石蜡切片病理诊断：能够对各种送检病变组织做出病理诊断，尤其对癌症早期确诊极为重要；手术中快速冷冻切片诊断：为临床确定诊断及手术范围提供依据；接收驻城医院术中冰冻快速诊断及周围县市病理检查和疑难病理会诊；脱落细胞学和穿刺细胞学诊断：以确定有无癌症存在；液基细胞学检查：适合宫颈癌、肺癌和直肠癌癌前筛查；尸检和法医解剖：对死因不明和有科研价值的尸体进行解剖，促进医疗水平提高并协助法医作出正确法医诊断；动物实验和科研：结合有关专业进行甲状腺肿瘤、乳腺癌等分子病理学研究；与综合医院病理科建立网络联系，开展远程病理会诊等多项技术。 服务范围全面开展病理学检查，为临床诊断、疾病治疗和判断病人预后提供科学依据。
主要业务工作有：常规石蜡切片病理诊断：能够对各种送检病变组织做出病理诊断，尤其对癌症早期确诊极为重要；手术中快速冷冻切片诊断：为临床确定诊断及手术范围提供依据；脱落细胞学和穿刺细胞学诊断：以确定有无癌症存在；尸检和法医解剖：对死因不明和有科研价值的尸体进行解剖，促进医疗水平提高并协助法医作出正确法医诊断；动物实验和科研：结合有关专业进行甲状腺癌、乳腺癌和脑胶质瘤的分子病理学研究。
科室与病理周新津、FredSilva等建立了密切合作关系，定期来医院进行专题讲座，与北京总院病理科纪小龙，山大齐鲁医院周庚寅等有技术合作，定期来医院进行业务指导；天津肿瘤医院张连郁，北京友谊医院周小鸽，省立医院王家耀主任，千佛山医院孙青主任等为医院会诊指导。 开展的技术项目：
1、免疫组织化学检测（如：雌、孕激素受体检测）。
2、60多种免疫组化染色（如：淋巴瘤分类，垂体腺瘤的功能分类）。
3、肿瘤分子病理学检测（如：肿瘤基因受体检测）。
4、20余种特殊染色。
5、免疫荧光自身抗体检测（如：肾小球疾病诊断）。
6、病理图象分析技术等。
7、病理会诊和远程病理会诊。
8、继续医学教育远程语音病理讲座。
